تأسس المركز القومي لدراسات الشرق الأوسط عام 1989 باعتباره “مركز بحثي” و”بيت خبرة”، يضم عددًا من الخبراء والمستشارين وصناع الفكر والرأي في مصر، وقد جمع المركز منذ إنشائه خبرات ممتدة ومتنوعة من شخصيات تولت مواقع قيادية في الدولة المصرية، حيث أسهم في التأسيس كل من: مستشار الأمن القومي الأسبق، ورئيس جهاز المخابرات الأسبق، المستشار “حافظ إسماعيل”، ورئيس أركان الجيش المصري الأسبق، الفريق “إبراهيم العرابي”، وعدد من رجال المال والأعمال.

وقد تتابع على رئاسة المركز القومي لدراسات الشرق الأوسط عدد من القيادات الدبلوماسية والعسكرية والعلمية البارزة، حيث ترأسه السفير “صلاح بسيوني”، وهو أخر سفير مصري في الاتحاد السوفيتي، وتلاه اللواء أركان حرب “أحمد فخر”، الذي عمل مستشارًا لأكاديمية ناصر العسكرية العليا (الأكاديمية العسكرية للدراسات العليا)، ثم السفير “حسن عيسى”، واللواء الدكتور المهندس “محمد نبهان سويلم”، ثم تلاه اللواء الدكتور “محمد شفيق”، ثم اللواء الدكتور “محمد مجاهد الزيات”، واللواء الدكتور “أحمد الشربيني”، ثم اللواء الدكتور “خالد الخمري”، كما يتولى رئاسة المركز في الوقت الراهن اللواء “طارق عبد العظيم”.

وقد شارك باحثو المركز منذ إنشائه عام 1989 في عشرات الفاعليات والأنشطة، ونجح بشكل فعّال في الانفتاح على مؤسسات الدولة المصرية، كما قام المركز باستضافة العديد من اللقاءات والاجتماعات من دول: الولايات المتحدة، وروسيا، والصين، وإسرائيل، وفرنسا، وتركيا، وغيرها، كما شارك المركز في فاعليات شبكات مراكز البحوث الدولية في الولايات المتحدة، ونجح في المشاركة في مسارات دولية في إطار عملية السلام بين العرب وإسرائيل، وفي عدد من الفعاليات العربية – الأمريكية.